在抗日战争期间，从《卅年专刊》的内容看，关于南洋的真耶稣教会没有什么具体情况的记载，但知道一些新建的分、区会教会组织。
马来亚。一九四一年，周文才建双溪大哖区会。而《真耶稣教会圣灵报》第二卷第六期（一九四八年六月十五日发行）的通讯中说，是由何重生在战时开创的。
北婆罗洲。一九四零年十二月，张尊一等建文对乡区会；张尊一，《真圣报》第二卷第四期（一九四八年四月十五日发行）作张“敬”一。保佛，在日占期间，据后来何提摩太回忆说：“我们仍得有自由聚会拜神”，信仰生活无什大碍。
爪哇。一九三九年八月建吧城分会，创始人不详。一九四二年一月，萧仕提反创建万隆分会。
其他，张巴拿巴于抗日战争期间在南洋，其活动情况，已见前述。
此外，在一九四七年召开的第十一届全体代表大会上，有星加坡特许代表应锡祺的报告，说明了一些情况。谓：“张巴拿巴在怡保受某姓妇人之供应（当为林成就之妻刘腓比）后，又到实吊远打本会孙执事，诬告本会执事。”而详细情况，不得而知。