真耶稣教会自魏保罗创建以来，就出现过分裂现象，只不过还是人员之间的嫉妒而已。见前述。魏保罗去世之后，北方出现的分裂，则多带有教义上的分歧。这些内容见于真耶稣教会在各地发展的历史中。张巴拿巴擅自在长沙召开三大，成为南北分裂之势，亦与教义分歧有关，即，与魏以撒改变乃父之所传有关，已见前述。之后，南方教会也出现了一些分裂、离心现象，但不是在教义上，而是在如何对待教会组织的规章上。斗争情况，曾引起局部教会的变化，而最后，竟然引发出全局性的震荡。
在开革张巴拿巴之后出版的，《圣灵报》真耶稣教会第六次临时全体大会特刊上，郭多马特撰《胜过魔鬼工作面面观》一文，对斗争进行了总结。其概如下：
首先指出，“本会的仇敌，就是魔鬼。但是，本会何以受敌于魔鬼呢？盖有真神与本会同在。”
而魔鬼的工作可以分为两个历史时期：“（一）抵挡真理的时期；（二）破坏统一的时期。”第一个时期指“未有总部之先”。即，民国十五年（公历一九二六年）之前。此时“魔鬼看见灵工大展，得救的人数越见增多，则利用各教会的人，出来毁谤与搅扰，甚至满心嫉妒，而有种种的逼害……。”这应该是指同外国各公会的矛盾和斗争。在这个历史时期的真耶稣教会，郭多马说是“从外面看来，确有非常胜利的发展。究其内容，则如散沙一般。没有组织，没有统系，也没有联络合一的办法。因此，魔鬼不怕本会之发达与人多。也不怕称为什么真教会。只怕真教会统一起来，团结一致，建立总部的根基。好象当时犹太人的仇敌，不怕散居的犹太人多，只怕耶路撒冷被建造，联络整齐为一座坚固的城邑一样（诗一百廿二 3；尼四 7、8）。于是，乘着本会如散沙的时候就撒下不良的种子，而且，引诱人发好奇的心，妄谈异象，谬说预言。有的争名贪利，有的结党纷争。遂发生种种错谬，害人跌到而灰心。此所以本会在民国十五年（1926）以前，每被魔鬼摧残，现出此兴彼朴零落不堪的景象。”
郭多马的这个总结，不用说，是很有道理的。这里要提出的问题是，所谓“零落不堪”的教会包括到多大范围。包括所有的教会在内，即，也包括北方魏以撒等吗？如果包括，那么，已经有一个总会了。那么，不包括？但有一点是可以肯定的，无论包括还是不包括，在民国十五年以前，郭多马的头脑中，没有总部。这种状况，当非只有郭多马一人，而是相当多的会众都处于这种状况之中。或者，在当时的总会之中，张巴拿巴的威望最高，会众心目之中，只有张巴拿巴，而无总会。这应该是张巴拿巴能够冒充发起人的一个非常重要的客观条件。再加上魏以撒于一九二二年始，改变乃父之所传，被部份会众抛弃，实在是非常容易的了。
之后，“经过火炉似的的第一期神学会里，炼出一个总部来，就是众长子之会所共聚的总会，完全由着真神所设立的。”进入第二个历史时期。
在第二个时期，“魔鬼亦必再施破坏统一的手段……分作三面攻来。”
“第一面攻来的，就是反对规章派”。“这一派人……一见总部成立，以为不合圣经的组织，则到处毁谤其所不晓的事，引诱弟兄来归附自己。说不可与总部联络感情，想也设一个机关，与总部成了对垒。不时掷下《真光报》的小弹，以助折毁的功夫。”然而，不到三年，就垮掉了。被引诱的“多回转过来”，所设“对垒”也“倒了”，“那一般掷弹的，无不反炸自己了。”
在这里，郭多马说的是很全面的。他们的理由是规章不合圣经，所以要反对规章，并设立了与总部对抗的机构，还出版了报纸《真光报》。关于反对规章派，资料中极为少见。除此处而外，只在福建真会史中提到过曾经反对过规章的陈见信。请参见本书第六编第十二章注释。而《真光报》，《卅年专刊》是完全肯定、完全赞赏的。因为，其中有揭露张巴拿巴冒充发起人的文章。参见本编第四章第三节。而反张干将郭文俊、南洋黄保罗，以及牛云超等人，是否也反对规章，由于笔者未能找到《真光报》，就不得而知了。《卅年专刊》的编者，只注意证明真耶稣教会的创始人是谁，到了不顾其他历史真象的地步了。
“第二面攻来的，就是违反规章派”。这派人，郭多马说：“原是服从规章的，且承认规章有切实成立的必要。迨后以不利于己的狂妄或贪婪起见，就被魔鬼勾引去，反戈向总部打来。说什么开改造大会，要根本铲除。竟以一人犯罪，敢将全体的本会一同诬蔑在内。又敢高抬自己。不怕与总部脱离关系。一时崇其说者，则亦有出书去拥戴，邦助速开北平的大会，实现真正的总部。俨然以固有总部看作张氏个人的私产。”这应该是指孙彼得要在北平开什么“反张倒魏”的改造大会。请参见本编第五章第二节，及第二节注释①。值得注意的是，郭多马的说法同《卅年专刊》有明显的不同，郭多马没有说这派人同时也“倒魏”。“反张倒魏”是《卅年专刊》的说法。请参见本编第五章第二节。郭多马明确指出，这派人错在“竟以一人犯罪，敢将全体的本会一同诬蔑在内”，“俨然以固有总部看作张氏个人的私产”。即，总部不是张殿举巴拿巴个人的私产，不应该因为他个人的问题，而归罪于全体，归罪于总部。而“反张倒魏”的说法，显然没有区分个人与全体的不同责任，而把教会当作不是张家的，就是魏家的了。《卅年专刊》只是一味地证明真耶稣教会乃魏保罗所创，到了不顾其它历史事实真象的地步，暴露出编者视真耶稣教会为魏家私产的内心世界。在广大信徒和基层教会中，对于这个问题，有张派，有魏派，也有既反张也反魏派。但也有许多信徒和基层教会提出了与此相反，完全针锋相对的观点。认为，无论是魏保罗还是张巴拿巴，都不是教会的创始人，他们只不过是神所藉用的工人而已。即，信神，而不信人。而信“人”是很危险的。因为信者很可能成为所信之人的私产，成为宗派斗争的马前卒，教会则会陷入永无休止的派性斗争，或者，四分五裂。“第三面攻来的，就是废除规章派。”这说的是张巴拿巴废除总部改定的规章。这放到后面去说。参见本书第四编。