一九四五年八月十五日，日本帝国主义战败，中华民族八年苦难终于结束。我们现在能见到的真耶稣教会总会在抗日战争结束后的第一项事务是为民国卅五（一九四六）年度的经费预算及动员全会捐款事宜。
《卅年专刊》所刊登的一九四六年度的经费预算为：
| 项目 | 每月所需数 | 全年所需数 | 附 注 |
| 福食 | 二十五万元 | 三百万元 | 总会各部负责及眷属二十五口，每口按一万元计算 |
| 零用 | 七万五千元 | 九十万元 | 每人每月按三千元发给 |
| 旅费 | 三万元 | 三十六万元 | 总会专任工作人员六名，每人每月按五千元计算 |
| 杂支 | 三万元 | 三十六万元 | |
| 图书 | 一万元 | 十二万元 | 书、报、参考材料 |
| 邮电 | 一万元 | 十二万元 | |
| 文具 | 五千元 | 六万元 | |
| 招待 | 二万元 | 二十四万元 | 中外远地来宾及本会重要工作人员之接待费用 |
| 添置 | 二万元 | 二十四万元 | 桌椅、家具、床铺用具之购置 |
| 工友 | 三万元 | 三十六万元 | 传达及杂役二人，每人工资伙食按每月一万五千元计算 |
| 合计 | 四十八万元 | 五百七十六万元 | 总会迁移及各位负责集中旅费尚需一百万元 |
总预算是五七六万元。为此,在民国卅五年（一九四六）二月二十日，总会以总字第四十四号代电通电全会开捐，其文谓：
“阿们，哈利路亚，奉主耶稣圣名电达中外各地本会 诸位长执理监安鉴，愿你们从神大得恩惠能力平安，阿们！本年度总会经费必须六百余万元，兹经决议列表公布周知。查过去缴纳总会经费多未完善，是以总会同人无不备受负债之苦痛。虽有抗战阻拦之故，亦有办法不良之因。倘每位灵胞全年能捐五百元，只万余人即达目的。若有灵胞能多担几份则更不难完成矣。且可分期汇缴，当无特难也。凡在六月以前之经费仍汇陪都，六月以后之经费可汇南京。此电知仰各支部及直属之分会，议定专人办理具报为祷。阿们此启
真耶稣教会总会代理事长 魏以撒 丑苛
主任秘书 董玉林
南京本会会址：在洪武路景贤里，所有函件交蒋约翰理事即妥。”
从这个经费预算及其经费来源看，真耶稣教会在经济上是完全独立的，不依靠任何外来资助，完全由全体信徒支撑。只是不知道当时的物价指数，无法判断五七六万元是多或少。
此时已是抗战胜利以后。值得注意的是，在开捐通电中已经透露出来总会即将迁回南京的消息，而且已经制定了计划，在当年六月之前回南京，因为捐款在六月以后汇南京。
抗日战争胜利了，真耶稣教会又不断地发展壮大，魏以撒的雄心也就更加壮大了。张石头《真耶稣教会史》记载了魏以撒在总部刊行的《真耶稣教会报》（民国卅五年，一九四六年，三月十日号；发行人魏以撒）撰文提出的总部计划：“第四，本会四年计划教育工作：一、创设大学 四年内应由总部创办大学一所；二、兴办中学，在四年内，在华北、华中、华南、南洋兴办中学四所。第五，指导合作社 甲，消费合作社，凡在百人左右的本会即可成立消费合作社一所，供给社员需要，利不外溢；乙，合作农场，这是关于农业方面的生产；丙，生产合作社，这是属于工业方面的生产；又，合作社公约：A，必为本会灵胞；B，必献全部纯利十分之一，充教会捐款。第六，发行日报 在四年内，一、应创办日报一种；二、家政季刊；三、发行月刊；四、发行传单；五、编印书籍。第七，整顿捐款：说明，一切设施，非财莫办。以如此伟大责任之本会，欲以可有可无之捐款行之，实有难能之苦，不可弄得似有似无，遗（贻）笑大方。若是各地传道人永远任凭拉债忍饿，也没有人过问，则不必要什么组织还好，所以要使他们清高廉洁，不背贪财之恶名才好：一、整顿会员，按社会部之规定，会员当有会费，每年照常缴纳。凡受水洗之灵胞，无论大小男女，皆当每年纳一定之会费，四年内务期普遍实现，其数额无妨较小一些……。二、实行十一捐……。三、奉献遗产 在四年内，当倡有两千人奉献其遗产。第十四 总会年来经费，除渝会每月支持办公费外，各地所寄甚少。魏长老（以撒）生活费，每月需廿余万之钜，幸平价物品辅助一部，但大部份皆悉变卖衣物，凭信心苦度中。”
以上计划，应当说是相当庞大，其雄心壮志非同一般。若与当初开革张巴拿巴时批判其教会建设的计划相比，显然要大得多。这个计划如果能够实现，真耶稣教会将变成独立的经济、教育实体，不单只是信神的教会了。