《卅年专刊》有一篇《广州分会史略》，作者为谁未署名。但从文章内容行文口气看，是张宁法所撰。《史略》没有从广州真耶稣教会的最初始兴说起，而是从沦陷开始的。既便如此，也只是三言两语带过，实质内容是从沦陷结束、复员之后开始的。虽然如此，毕竟也还有一些沦陷期间的描述。
广州凤凰岗教会，“经过沦陷八年又聚又散数次，经历饥荒、艰难困苦、拦阻、丧失、死亡，离世兄弟姊妹有过半。幸蒙主耶稣的灵启示和指导，使我持定真理忍耐，保守前进。”
香港教会。香港沦陷后，信徒们都各散西东。传道者黄基磐执事因家庭生活经济断绝之苦，难于回乡。那时的教会，因为出入交通阻碍，分开两处，作家庭聚会：一在九龙曾路得执事家，一在香港徐大卫家。后来，曾路得家没有聚会了，但“蒙神祝福，古撒拉执事、徐大卫执事把教会坚持到底，经过一切困苦艰难，不能言状。”
新陂教会。在沦陷期间，经各样兵灾盗贼，信徒分离四散，“如灯台熄灭一样”。
石门金竹山祈祷所。俱是外邦人进入的，原由甘约伯执事负责。在沦陷期间受灾害多次，死伤多人。屡次逃离村庄，到山岭旷野中躲藏，食宿无定。“因有政府游击队，另有共产军队，又有日本军队，常常冲突。这祈祷所因此多年无聚会拜神了。”
中山教会
一九三九年，日军击陷中山，教会会务因此而停顿。
一九三九年，沙溪圩成立祈祷所，由冯爱真女执事负责。林信玲、胡秀娟等尽力帮助讲道。
一九四一年秋，石门开献堂典礼及灵恩会，石岐教会派梁耀基、欧汉琛前往帮助；并成立祈祷所，派甘约伯先生为负责。
中山有四处祈祷所：石岐、西桠、石门、沙溪，但传道人只有一位，即梁耀基执事。每年按月奔走于四个地方，“轮回流动牧养羊群”。
沙头角，一九三八年（民国二十六年）一月十二日成立真耶稣教会之后，到一九四七年以前没有找到记载。
大埔，在丘马利亚、丘矶法二位执事努力工作的基础上，于一九四零年十二月六日成立了大埔圩真耶稣教会。
樟木头教会
樟木头真耶稣教会，是因为丘马利亚、丘矶法两位执事在沙头角、大埔“奉耶稣名医病赶鬼”给樟木头村种下的种子，“感动了我们全乡，都愿作真神的子民，甘心同信一主一灵”。在一九四一年的一月二十日，请马利亚、丘矶法、丘提多、廖雅各等在南村开办真耶稣教会。于是廖雅各本村，全村“均得主恩，信奉真教”。
真耶稣教会在樟木头的发展，也曾遇到过一些阻力。丘马利亚的记载中说：“在成立教会的时候也有撒但的攻击。曾有本市小学校校长及商会会长控告真耶稣教会异端异教，集会扰乱治安，应马上赶出等。后经官方查问，经执事解释，了解而去。以后又作二次控告，官方令他害天文（？，原文如此），并告诫以后不可随便控告。撒但的鬼计失败了。从此他们对教会不敢攻击。撒但又转向矶法身上袭击，被捉了几次。见他本人见证。”
丘矶法的见证反映了丘矶法等受日军、及一些奸人利用日军的迫害。在一九四一年，丘矶法“与灵胞李炳被日军捉去，自知必死，就大声喊哈利路亚十余声，将灵魂交与主耶稣安排。圣灵感动日军用笔写字问我们是作何事。我说是真耶稣教的，那日军就将我们放了。又民卅二年（一九四三）十二月，沙头角的教会被日宪兵占用。恶人利用日军打我甚重。民三十四年（一九四五）五月，又被奸匪捉我，送到深山内一小房，囚困至六月初一晚，要杀我。听他内部人告诉我，我就祷告。蒙圣灵指示由瓦间逃去。在森林里住了四夜三日，吃酸藤叶充饥。初三日夜间，由高山往下爬时，有一重约八十斤巨石，由头部、腰部压过。这夜又跌入被水浸了三十分。这时求主救我，现在水里，免被恶人杀死。到天亮圣灵指示，到中队部求救。至第五日解到大队部，我姐马利亚及廖雅各调解，六月十二日被释放。
同年七月十八日，又被奸徒捉去，囚了七天。以上所受苦难在人意度绝无生理。神的奇妙。所受的苦楚不小，但终不能伤了我的性命，感谢主，阿们！”
在抗战期间福建新建区会，据《卅年专刊》统计表，有：一九三八年七月，吴约生创建石岐区会。一九四一年一月，丘矶法建樟木头区会。祈祷所有：一九三九年，梁耀基创沙溪祈祷所。一九四一年，甘约伯创石门祈祷所。