这部份的资料，完全依赖于张石头所著《真耶稣教会史》一书。
前面已经提到，张巴拿巴于南京召开中华真耶稣教会第二次全国大会之后，已称“教会元首”。一九三八年的六月十二日，张巴拿巴等人经粤汉路抵达香港。在九龙、香港召开数次灵恩大会，“圣灵大降，际此乱世，人多向神，教会都非常兴旺”。年底，张益寿、曹光洁等返回上海。南京大屠杀之后，曹光洁由上海返回南京。
张巴拿巴在香港呆了半年多。广州沦陷后，与内地音信更是难通，又屡接南洋怡保教会函邀。遂于一九三九年二月廿二日抵达吉隆坡真会，会见了张弥加等。二月廿七日抵达怡保。据笔者得到的中华民国二十八年（公历一九三九）正月第一期《角声报》，张巴拿巴发布的“公函一件”，张巴拿巴到达怡保的时间是在“三月二十七日”，不是“二”月二十七日。
陈光藻说张巴拿巴在到南洋之前，曾到福州、仙遊。后与陈文秀（提摩太）共赴南洋。
怡保李塞特一向全权管理林成就的财产、营业。一九三七年十一月林成就去世。不久李塞特与林氏之妻刘腓比因家务失和，张巴拿巴调解不成，林氏子女诉讼于公庭。这在人口不多的怡保，成为社会各界广为关注的事件。张巴拿巴为教会名誉计，劝李、刘二人自动辞去教会公职，待诉讼结束以后再行恢复。刘腓比接受劝告，辞去执事之职，但李塞特坚拒不允，张巴拿巴遂将其监督之职革去。
一九四零年，应砂捞越米里埠庄陈氏二姐妹之邀，与张西拉执事前去传道，施洗四十余人。第二年，又应沙巴亚庇某李太太之请，独自前往讲道，约一个月有余。一九四一年七、八月间，张巴拿巴同刘腓比前往实吊远看视教会，在爱大华遇见俞圣洁、姚益彩、黄多加等人。几年前，支持上海总部的俞圣洁，这次见面，却如同故人相逢一样，乃致引发孙耀光及福建陈马利亚大怒；孙耀光甚至要打俞圣洁。在实吊远，不知是谁向英政府报告，说张巴拿巴是日本间谍，月获五万元活动经费。十一月，怡保刑事调查局，派员调查，见张衣着简单，只有《圣经》，不象，遂道歉而去。
当年，十二月八日，日军南进，巴拿巴与刘腓比等随大众逃往新加坡。在吉隆坡被捕至警局。由一英籍警官盘问，结果也觉得不象是日本间谍，于是再三道歉，并用车送回教会。张巴拿巴在新加坡一直住到英军投降，日本山下奉文大将接管全马之后，才返回怡保。家人则仍留日军占领的香港。
后受爱大华真会之邀，到此长住，看顾教会。在此优哉遊哉地过了三年多的休养生活。一九四七年复刊的第一期《角声报》，刊登了张巴拿巴的《南遊记》一文，详细记述了到马来西亚以后的情况。关于在爱大华的三年多，如此描述：“我接受爱大华本会之再三邀请，乃前往该地，住在姚益彩家中。他的夫人俞圣洁及诸同灵长执热烈招待，朝夕祷告聚会。我在这悠（幽）静美丽的田园中，休养了三年多。自我传道卅余年，从没有好好休养过。在这里灵性大有增进。有黄多加、范靠主、单白石（长老）、胡哈拿、李爱主、徐阿森、姚益彩夫妇、四妈等执事，朝夕相处，谈论主神的道理。三年来，虽也在许多压迫下，但精神肉体均极健康，其间神迹奇事，不胜枚举。其间也有惊人的恐吓，靠着父神，一一得胜。凡神藉我所说的预言，皆一一应验，分毫不爽，这是真神的特恩。”